Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms