Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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