Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM15Q9C019 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms