Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-6Q9BXR3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms