Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms