Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED2Q9BTP6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms