Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM79Q9BSE2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms