Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms