Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms