Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms