Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCT8L2Q96SF2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms