Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
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