Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms