Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms