Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRFBP1Q8NEF9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms