Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms