Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms