Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms