Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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