Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED27Q6P2C8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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