Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTN3Q6NUS6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms