Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms