Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms