Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM208BQ5VWN6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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