Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms