Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms