Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms