Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms