Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms