Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms