Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms