Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms