Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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