Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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