Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JMJD1CQ15652 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms