Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18Q15532 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms