Protein–RNA interactions for Protein: Q15334

LLGL1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1Q15334 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LLGL1Q15334 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms