Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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