Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms