Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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