Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms