Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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