Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms