Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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