Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ATP1A4Q13733 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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