Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMS2P11Q13670 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms