Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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