Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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