Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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