Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms